Nelle biblioteche del sistema sono presenti alcuni fondi di particolare pregio.
Segnaliamo in particolare:
- Fondo Barresi (Biblioteca di Erba)
Include opere storiche e politiche su Fascismo e Comunismo - Fondo Pirovano (Biblioteca di Erba):
Include memorialistica della Prima e Seconda Guerra Mondiale, non è attualmente presente su catalogo collettivo provinciale. - Fondo Monsignor Spirito Colombo (Biblioteca di Brenna):
Include monografie cartacee ed enciclopedie di arte, musica, archeologia, storia, storia locale, religione, donate alla biblioteca dal 1981 al 1998. Circa seicentocinquanta titoli sono presenti sul catalogo provinciale.